桶装水开封后细菌超标，这个命题本身就不准确。到底是桶装水本身打开盖后细菌超标，还是通过饮水机流出的水细菌超标，这分别指的是两个概念。一般来说，桶装水本身细菌不会超标，因为我国对此有严格的控制，也有相关的标准来制约。从桶装水的出厂日期算起，合格的矿泉水开封三天细菌很难超标。目前，通常情况下，桶装水都是跟饮水机搭配使用的，而因饮水机本身二次污染造成的桶装水细菌超标则较多。特别是饮水机出水口长期暴露容易引起细菌超标。
实际上，准确的说法，应该是桶装水开封后容易引起微生物污染。而微生物污染程度，取决于水的品种和来源地，周边环境的污染程度，以及存放的时间长短。水源地不同，水质不同，那么细菌含量也会稍有差别。目前，与矿泉水相比，纯净水的污染程度更大。矿泉水是指从地下深处自然涌出的或经钻井采集的水，含有一定量的矿物质，如钙、镁、钾、钠、偏硅酸、锌、硒等。国家对一些微量元素的含量是有要求的，例如锌必须大于等于0.2毫克/升，硒必须大于等于0.01毫克/升。而纯净水是以直接来源于地表、地下或公共供水系统的水为水源，经适当的水净化加工方法制得的水。相比于纯净水，矿泉水的抑菌能力较强，抗污染能力强一些。因此建议优选矿泉水，且开封后尽快喝完。
水与人的生存密切相关，由于水的包溶性强、溶解性强、渗透力强等特性，而且水无孔不入，“看不见”的各种污染物质无时无刻无处都在通过水威胁我们的健康，水的安全性显得比一般食品安全更为突出。目前我国对于水能不能喝的标准，现在很多国家已不再采用菌落总数作为标准了，而是注重水中致病细菌的情况。而包装饮用水国标之所以新增铜绿假单胞菌作为检查项目，是考虑到了铜绿假单胞菌具有致病性。铜绿假单胞菌不合格项目可能引起食用者腹泻、急性肠道炎、皮肤炎症等病症。国标中还明确指出，每250mL水样中铜绿假单胞菌不得检出，并且要求出厂前对每批次成品进行铜绿假单胞菌检测。如果检出，则为不合格产品，应该召回和停止销售。
